פיתוח שיטה המזהה שחקני מפתח בעולם המיקרואורגניזמים

מין מפתח (keystone taxa) הינו מין בעל תפקיד חשוב במיוחד ביציבות המערכת האקולוגית שלו. כיום, זיהוי מין מפתח מתוך נתונים המתקבלים מריצוף בתפוקה-גבוה (high-throughput sequencing) הינו תהליך מאתגר במיוחד. נוסף על כך, בעוד מרבית המודלים של אינטרקציות בין מיקרואורגניזמים הקיימים היום מניחים אינטראקציות זוגיות, לא ברור אם אכן הן האינטראקציות הדומיננטיות במערכות האקולוגיות. ד"ר אמיר בשן מהמחלקה לפיזיקה באוניברסיטת בר-אילן יחד עם הדוקטורנט שלו ד"ר גיא עמית פיתחו שיטה חדשה לזיהוי מיני מפתח לפי השפעתם הכוללת על שאר הקהילה, שאינה מניחה ידע מוקדם על אודות אינטראקציות זוגיות או כל דינמיקה אחרת. כאשר השיטה יושמה על רצפים מהמיקרוביום של מערכת העיכול האנושית, החוקרים זיהו מספר מיני מפתח פוטנציאליים וראו שהמינים שזוהו לעיתים הם חלק ממודול מפתח (keystone module) –  קבוצה של מינים עם מתאם גבוה של דפוסי נוכחות-היעדרות. עבודתם של ד"ר בשן וד"ר עמית, שפורסמה בכתב העת היוקרתי Nature Communications, מהווה צעד גדול לקראת זיהוי אמין של שחקני מפתח של קהילות מיקרוביאליות מורכבות.

למידע נוסף >>