AI חושף את סודות הקולטנים של תאי T

קולטנים מסוג TCR הם חלבונים המצויים על גבי תאי T של מערכת החיסון, שתפקידם לסייע בזיהוי סכנות ואיומים כדוגמת זיהומים. תאי החיסון של כל אדם מבטאים מערך מגוון ביותר של רצפי TCR, כאשר חלק מן הרצפים משותפים לרבים בקרב האוכלוסייה הכללית (רצפים "ציבוריים"), וחלקם ייחודיים לבני אדם מסוימים – רצפים "פרטיים". במאמר שפורסם לאחרונה בכתב העת Science Advances, פרופ' סול עפרוני ועמיתיו מתארים שני מודלים חישוביים חדשים, CVC ו-scCVC, שפותחו לשם ניתוח אנליטי של רצפי TCR תוך שימוש בלמידת מכונה מתקדמת. המודלים אומנו על מאגר נתונים עצום בגודלו, המכיל מיליוני רצפי TCR שנאספו הן מריצופי רנ"א כלליים והן מריצופים ברמת התא הבודד. שני המודלים, הן זה הכללי (CVC) והן הספציפי (scCVC), הצליחו להבחין באופן יעיל בין רצפים "ציבוריים" ורצפים  "פרטיים", לזהות דפוסים המקושרים לגנים ספציפיים ולספק תובנות הנוגעות לתאי חיסון ייחודיים. בעבודה זו יש הדגמה מעמיקה של חשיבות השימוש בכלים חישוביים במחקר, ובמיוחד בחשיפת דפוסים נסתרים בפעילותה של מערכת החיסון. בכך, החוקרים מתווים דרך להבנה טובה יותר של מערכת החיסון, כמו גם לפיתוח תרופות ממוקדות ומותאמות אישית.